73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1288 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1288  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  100 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2694  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  61.4 
 
 		 282 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2049  hypothetical protein  51.82 
 
 		 275 aa  292  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1729  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  52.22 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0200  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  50.55 
 
 		 298 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2048  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  51.85 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4658  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.27 
 
 		 275 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1085  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  51.48 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.196121  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3201  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  46.13 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3421  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.83 
 
 		 323 aa  222  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4792  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  50.93 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239471  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5280  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.57 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.970105  normal  0.551146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2788  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  46.88 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000742326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2074  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  45.83 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.334644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1809  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  44.73 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2636  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.86 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.22 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.955887  hitchhiker  0.00580332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2968  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  40.07 
 
 		 1139 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.03 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.06 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.11 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1210  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.77 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0358548  normal  0.452165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0473  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.47 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.24 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  29.03 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  26.24 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.1 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.43 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.97 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3595  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.56 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232061  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40 
 
 		 468 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  33.71 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.53 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2020  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.57 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.22 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1291  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.71 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.71 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.939597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4711  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.98 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728749  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1747  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  31.21 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.795465  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.4 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1416  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.51 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1352  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.51 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000618101  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.23 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.86 
 
 		 496 aa  45.4  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.67 
 
 		 512 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.44 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  23.86 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3730  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit, coxM-like protein  33.33 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.64 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  37.65 
 
 		 492 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  30.64 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  30.91 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  29.14 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4414  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.71 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.939465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10380  carbon monoxyde dehydrogenase medium subunit  30.46 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3561  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.48 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1218  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  27.75 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.52 
 
 		 492 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35 
 
 		 492 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.65 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.58 
 
 		 507 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0113  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  35.71 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.64 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  35.42 
 
 		 845 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.41 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  30.23 
 
 		 494 aa  42.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.07 
 
 		 450 aa  42.7  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1676  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.31 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.991973  normal  0.682256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.94 
 
 		 530 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.73 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1638  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  27.37 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.921721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2698  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.5 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0195145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>