51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0637 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
277 aa  544  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  83.75 
 
 
277 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  83.94 
 
 
277 aa  461  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  82.91 
 
 
277 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  86.3 
 
 
298 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  81.09 
 
 
276 aa  447  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  82.18 
 
 
276 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  79.2 
 
 
276 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  79.56 
 
 
273 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.44 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.64 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.64 
 
 
277 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.64 
 
 
269 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.96 
 
 
270 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.33 
 
 
270 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  42.53 
 
 
270 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.61 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.76 
 
 
270 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.6 
 
 
271 aa  188  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.53 
 
 
270 aa  188  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  42.86 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.08 
 
 
279 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.08 
 
 
279 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  34.59 
 
 
277 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  38.26 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.72 
 
 
276 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.08 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  36.36 
 
 
268 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.06 
 
 
286 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.71 
 
 
268 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.34 
 
 
268 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  32.43 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  30.25 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  27.03 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  25 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  26.01 
 
 
234 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  26.63 
 
 
239 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  27.45 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  24.05 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  25.21 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  24.57 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  23.6 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  26.91 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  24.24 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  26.91 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  28.65 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  25.25 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  25.9 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  25.1 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  24.59 
 
 
236 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.04 
 
 
210 aa  42.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>