More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1235 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1235  cold-shock domain-contain protein  100 
 
 
83 aa  164  5e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7022  cold-shock DNA-binding protein family protein  51.25 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal  0.604228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4194  cold-shock DNA-binding domain protein  51.25 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.69443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1791  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.25 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3513  cold-shock DNA-binding domain protein  51.25 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0841  cold-shock DNA-binding domain protein  48.75 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1914  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.91 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.59949  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  47.56 
 
 
68 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.741556  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0810  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.12 
 
 
69 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5491  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.5 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599855  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2980  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.5 
 
 
73 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0073832  normal  0.0936276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
69 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2005  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.5 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0886  cold-shock protein DNA-binding  47.5 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0757124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0311  cold-shock protein, DNA-binding  51.28 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3436  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0846  cold-shock DNA-binding domain protein  47.5 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.012505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1892  cold-shock protein DNA-binding  49.38 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3878  cold-shock DNA-binding domain protein  46.91 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.5 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.084577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0591  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.1 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1952  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.15 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3621  cold-shock DNA-binding protein  48.15 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4329  hypothetical protein  48.15 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2533  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.9 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0812  cold-shock DNA-binding domain protein  46.25 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.674883  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0003  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.1 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0495  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.1 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3723  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1810  cold-shock DNA-binding domain protein  46.25 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5378  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.22 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260469 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6274  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.25 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517051  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0603  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.15 
 
 
68 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5022  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.499823  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2846  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.72 
 
 
73 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4258  hypothetical protein  46.91 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321323  normal  0.982609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4677  cold-shock DNA-binding domain protein  46.91 
 
 
69 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.403947  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0270  cold-shock DNA-binding domain protein  47.5 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4458  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.5 
 
 
69 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1185  cold-shock protein DNA-binding  50 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0202677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1345  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2024  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.15 
 
 
68 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1893  cold-shock protein DNA-binding  47.5 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3143  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.57 
 
 
68 aa  66.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.15 
 
 
68 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.976411  normal  0.373537 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5339  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
71 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4644  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.5 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1798  cold-shock DNA-binding domain protein  47.5 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  50.65 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0954  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.91 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631034  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1676  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.31 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00586625  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1492  cold-shock family protein  42.31 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.136425  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3947  cold-shock protein DNA-binding  42.5 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246482 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6033  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.5 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.263263  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3625  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.25 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164813  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4315  cold-shock DNA-binding domain protein  42.5 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0374104  normal  0.166197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0367  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2750  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4533  cold-shock DNA-binding domain protein  45.68 
 
 
69 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1074  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.68 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0836241  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6591  cold-shock DNA-binding domain protein  41.25 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4164  cold-shock protein DNA-binding  45.68 
 
 
69 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.91 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5655  cold-shock DNA-binding domain protein  41.25 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2375  cold-shock protein, DNA-binding  46.91 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583398  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2199  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.21 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3140  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.12 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577228  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3653  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.15 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.820165  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5421  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.25 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.64967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0142  cold shock protein  40 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3209  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.522557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2176  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141033  normal  0.0176419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3257  cold-shock protein, DNA-binding  44.44 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5928  cold-shock DNA-binding domain protein  40 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2034  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.68 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1446  cold-shock family protein  43.94 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.215876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1056  cold-shock DNA-binding domain protein  45.68 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.102694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0078  cold-shock DNA-binding domain protein  38.75 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.176991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0246  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251668  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0217  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7552  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.21 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229595  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0009  cold-shock DNA-binding domain protein  43.9 
 
 
68 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4422  cold-shock DNA-binding domain protein  41.25 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3854  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.1 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260503  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2842  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.5 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3620  cold-shock DNA-binding protein  44.44 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1521  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.5 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490356  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0899  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.04 
 
 
70 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0093  cold-shock DNA-binding domain protein  38.75 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941798  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1752  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.44 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3161  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.5 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161902  normal  0.108125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2219  putative cold-shock DNA-binding domain protein  43.9 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0386  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.68 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0932  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.56 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1949  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589262  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0977  cold-shock DNA-binding family protein  46.84 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.717834  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.68 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>