35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4031 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4031  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  705    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.282109  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418a  hypothetical protein  54.07 
 
 
319 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3276  hypothetical protein  51.17 
 
 
323 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3803  hypothetical protein  39.73 
 
 
301 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3049  hypothetical protein  48.51 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  94 
 
 
828 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  77.78 
 
 
318 aa  86.3  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1894  MxaA protein, putative  31.41 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0870001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  84 
 
 
848 aa  83.2  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  82 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.85 
 
 
527 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  77.36 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  80 
 
 
628 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0904  alcohol dehydrogenase  80 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0785  MxaA protein, putative  30.46 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.05 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1823  hypothetical protein  30.77 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  83.72 
 
 
149 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  78.26 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  79.07 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2944  hypothetical protein  77.5 
 
 
227 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.234718  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8034  MxaA protein, putative  31.6 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.491837  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0689  MxaA protein, putative  26.81 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.538491  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0477  MxaA protein, putative  29.43 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2038  hypothetical protein  27.64 
 
 
290 aa  56.6  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.757215  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4626  MxaA protein, putative  28.15 
 
 
331 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0693913  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0868  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  75 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1913  MxaA protein, putative  29.28 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4512  MxaA protein, putative  29.59 
 
 
307 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.696333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4144  MxaA protein, putative  29.37 
 
 
307 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.470547  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2999  MxaA protein, putative  26.88 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0394676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  86.67 
 
 
365 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3533  ABC transporter related  82.14 
 
 
522 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4204  MxaA protein, putative  27.63 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138586  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  88.46 
 
 
438 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>