41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0661 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0661  microcompartments protein  100 
 
 
203 aa  411  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684671  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0185  microcompartments protein  63.83 
 
 
201 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0205  microcompartments protein  63.83 
 
 
201 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0196  microcompartments protein  63.83 
 
 
201 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1241  microcompartments protein  63.3 
 
 
201 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121817  hitchhiker  0.000132399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5567  microcompartments protein  63.3 
 
 
201 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276352  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0903  microcompartments protein  40.3 
 
 
213 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0498  hypothetical protein  41.85 
 
 
205 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0192  hypothetical protein  41.87 
 
 
217 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0201  hypothetical protein  41.87 
 
 
217 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0181  hypothetical protein  41.87 
 
 
217 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.344127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3396  microcompartments protein  43.43 
 
 
212 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455594  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05491  hypothetical protein  39.7 
 
 
258 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0547  hypothetical protein  40.54 
 
 
256 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.927734  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1876  hypothetical protein  38.69 
 
 
258 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06011  hypothetical protein  38.69 
 
 
258 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.845171 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05731  hypothetical protein  40 
 
 
256 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06031  hypothetical protein  40 
 
 
256 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06111  hypothetical protein  38.92 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.263609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3341  microcompartments protein  41.24 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00179128  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1237  hypothetical protein  41.38 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0553533  hitchhiker  0.00115187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5571  hypothetical protein  40.89 
 
 
225 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.824283  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0851  hypothetical protein  37.69 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08041  hypothetical protein  39.46 
 
 
256 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0749  hypothetical protein  38.92 
 
 
261 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.352203 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1617  hypothetical protein  38.92 
 
 
262 aa  142  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.216842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3094  microcompartments protein  41.84 
 
 
213 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4346  hypothetical protein  40.56 
 
 
210 aa  141  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1974  hypothetical protein  40.56 
 
 
210 aa  141  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1048  hypothetical protein  39.04 
 
 
204 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0404012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1702  microcompartments protein  41.41 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0218574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4911  hypothetical protein  43.48 
 
 
213 aa  138  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4051  microcompartments protein  42.71 
 
 
213 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4090  microcompartments protein  42.71 
 
 
213 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0200288  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3835  microcompartments protein  44.02 
 
 
212 aa  137  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5816  microcompartments protein  43 
 
 
212 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.799271  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4027  hypothetical protein  42.93 
 
 
207 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0665  hypothetical protein  37.75 
 
 
208 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306232 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1659  microcompartments protein  38.19 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2342  microcompartments protein  41.24 
 
 
209 aa  131  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000010897  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0520  hypothetical protein  40.82 
 
 
213 aa  126  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>