197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4747 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4747  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
273 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2181  hypothetical protein  43.98 
 
 
269 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0466384  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3543  phosphoesterase, PA-phosphatase related  55.56 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3491  phosphoesterase, PA-phosphatase related protein  46.26 
 
 
277 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126917  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.97 
 
 
702 aa  89  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1827  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.55 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.31058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.82 
 
 
676 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1015  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.54 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.54 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  36.64 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1443  PAP2 family protein  31.72 
 
 
214 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.12 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0270  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.69 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  35.75 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1183  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  31.82 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  38.24 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  38.24 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1181  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  31.82 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1379  PAP2 family protein  31.82 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  29.8 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.25 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1203  PAP2 family protein  31.82 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1301  PAP2 family protein  31.82 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1321  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.5 
 
 
238 aa  72  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.175223  normal  0.0541289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.53 
 
 
209 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1205  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.63 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1402  PAP2 family protein  31.03 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  29.14 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  34 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2154  PAP2 family protein  30.61 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2092  phosphatidylglycerophosphatase B  30.61 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2088  phosphatidylglycerophosphatase B  30.61 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0563174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2309  PAP2 family protein  30.61 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2335  PAP2 family protein  30.61 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.31 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3032  PAP2 family protein  30.61 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.21 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2417  PAP2 family protein  30.61 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2126  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.31 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2342  PAP2 family protein  30.61 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  41.53 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1429  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.56 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  40.68 
 
 
437 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1075  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.94 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1246  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.63 
 
 
331 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.656269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  42.61 
 
 
502 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.57 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.89 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0634  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.63 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  36.81 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0407  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.58 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.58 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.27 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.27 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2592  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.09 
 
 
371 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2200  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.71 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0646  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.18 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.89 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1362  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.63 
 
 
212 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.64 
 
 
192 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  32.03 
 
 
227 aa  62.4  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3047  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.67 
 
 
329 aa  62.4  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1164  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.11 
 
 
289 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0799  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.11 
 
 
313 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0478  hypothetical protein  27.5 
 
 
224 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000223119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0491  hypothetical protein  27.5 
 
 
224 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.143898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1402  PAP2 family protein  30.19 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.56 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.9 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2541  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  32.68 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.83 
 
 
438 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.61 
 
 
438 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2290  PAP2 family protein  36.27 
 
 
138 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.33 
 
 
218 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.27 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.32 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.28 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0508  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.4 
 
 
212 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.13 
 
 
216 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2226  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.84 
 
 
198 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2814  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
238 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000029245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4096  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.52 
 
 
221 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0710  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.540058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.5 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.26 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.79 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1458  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.93 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.17 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1018  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.14 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.03 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  31.82 
 
 
695 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  36.97 
 
 
438 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  28.11 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.97 
 
 
438 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.97 
 
 
438 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  37.82 
 
 
439 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  34.35 
 
 
248 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0458  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.33 
 
 
245 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000124469  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 
241 aa  55.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>