14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3753 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  64.54 
 
 		 262 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  67.47 
 
 		 306 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2492  hypothetical protein  67.02 
 
 		 281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000428836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  60.14 
 
 		 284 aa  314  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  57.5 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  58.36 
 
 		 289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  59.14 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2274  hypothetical protein  59.25 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2784  hypothetical protein  59.59 
 
 		 325 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290619  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3648  hypothetical protein  30.23 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  27.35 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  26.64 
 
 		 401 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  48.98 
 
 		 483 aa  42.7  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>