57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1669 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  73.39 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  69.77 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  80.19 
 
 		 111 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  70.09 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  72.97 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  72.97 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  67.16 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  66.92 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  55.86 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  47.75 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1421  putative transmembrane protein  64.96 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00663896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  47.27 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  50 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  53.21 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  47.78 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  48.45 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  47.41 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  45.92 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  45.83 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  45.92 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  45.92 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  52 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  44.79 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  46.43 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  46.43 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  46.43 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  46.43 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  46.43 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  44.83 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  45.24 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  45.92 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  47.22 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  46.53 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  34.96 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  40.4 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  41.9 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  33.04 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  34.15 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  27.35 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  26.5 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  28.85 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  34.25 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  32.88 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  34.25 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  34.25 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  31.48 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  32.88 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  34.25 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  33.68 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  34.25 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  34.25 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  30.17 
 
 		 139 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  32.88 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  29.41 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  28.83 
 
 		 129 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>