43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0866 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  84.55 
 
 		 130 aa  215  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  49.12 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  54.74 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  48.57 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  45.05 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  51.02 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  51.02 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  48.51 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  48.51 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  48.51 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  53.93 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  40.8 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  48.67 
 
 		 137 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  48.51 
 
 		 136 aa  90.1  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  41.96 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  41.12 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  53.41 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  53.41 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  53.41 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  53.41 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  53.41 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  53.41 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  51.96 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  53.19 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  44.04 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  47.96 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  41.9 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  41.9 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  39.05 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  37.93 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  36.36 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  38 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  39 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  35.64 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  38.05 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  39.78 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  31.07 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  34.67 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  28.04 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  29 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0736  hypothetical protein  39.13 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.374194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>