44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3783 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  100 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  65.15 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  72.88 
 
 		 138 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  72.88 
 
 		 138 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  66.92 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  75.24 
 
 		 111 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  68.47 
 
 		 146 aa  146  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  70.71 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  66.37 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  54.33 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  51.92 
 
 		 146 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  53.85 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  50.93 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  53.4 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1421  putative transmembrane protein  62.2 
 
 		 129 aa  97.1  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00663896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  56.38 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  48.84 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  49.23 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  50.54 
 
 		 178 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  46.96 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  51.43 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  54.08 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  52.33 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  52.33 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  52.33 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  51.19 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  50.57 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  50 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  35.34 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  54.17 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  39 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  44.07 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  32.2 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  28.91 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  34.38 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  30.15 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  29.41 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  36.62 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>