41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1335 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  100 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  92.31 
 
 		 130 aa  228  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  96.15 
 
 		 130 aa  206  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  96.04 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  96.04 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  96.04 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  93.22 
 
 		 136 aa  173  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  81.11 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  81.11 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  81.11 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  81.11 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  81.11 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  82.02 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  77.89 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  80 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  75.96 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  59.84 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  75.26 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  56.59 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  65.31 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  52.38 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  48.31 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  57.73 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  54.46 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  50 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  47.01 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  47.27 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  44.74 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  51.02 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  51.02 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  54.79 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  49 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  46.94 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  46.94 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  46.94 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  47.62 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  51.19 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1421  putative transmembrane protein  47.83 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00663896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  35.04 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  39.34 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>