57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0519 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  100 
 
 
137 aa  266  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.978517 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  50.85 
 
 
125 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  40.65 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  42.06 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0557  Protein of unknown function DUF2069, membrane  41.86 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  31.48 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  41.07 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  41.58 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  32.48 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  35.58 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  30.28 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  36.44 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  36 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  39.22 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  43.27 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  35.25 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  37.74 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  34.82 
 
 
122 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  34.04 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  39.6 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  39.6 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  42.86 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  36.73 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  37.89 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  34.62 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  31.97 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  32.23 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  31.5 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  37.86 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  36.36 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  34.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  36.79 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  38.89 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  38.89 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  38.89 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  29.75 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  39.78 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  37.5 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  35.35 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  32.56 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  37.9 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  29.66 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  29.75 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  29.75 
 
 
124 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  29.75 
 
 
124 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  29.31 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  29.75 
 
 
124 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  38.6 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  29.51 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  29.51 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  30.28 
 
 
123 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>