31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1753 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  73.39 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  73.39 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  73.39 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  72.58 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  72.95 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  67.48 
 
 		 123 aa  173  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  74.19 
 
 		 124 aa  170  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1693  hypothetical protein  72 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  61.79 
 
 		 123 aa  156  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2439  hypothetical protein  66.67 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1647  hypothetical protein  75.2 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2421  hypothetical protein  76 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0112375  hitchhiker  0.000913176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1969  hypothetical protein  67.48 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00366875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2349  hypothetical protein  75.2 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0136957  decreased coverage  0.000000000361738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1915  hypothetical protein  58.27 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  39.5 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  40.34 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  51.19 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  52.86 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  48.65 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  45.05 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  38.71 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  25.89 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  32.88 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0557  Protein of unknown function DUF2069, membrane  43.18 
 
 		 120 aa  43.9  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  35.9 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  42.42 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0898  translation elongation factor Tu  31.58 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  50 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>