27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2248 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  100 
 
 		 117 aa  229  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0557  Protein of unknown function DUF2069, membrane  50.56 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  35.85 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  31.86 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  45.83 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  31.96 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  35.35 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  43.06 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  37.61 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  36.79 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  37.61 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  25.71 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  25.89 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  34.86 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1245  hypothetical protein  38.83 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000160953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  41.33 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  35.64 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  31 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  41.33 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  39.44 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  41.33 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  29.91 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  31.73 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  28.57 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>