51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1421 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1421  putative transmembrane protein  100 
 
 		 129 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00663896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  64 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  69.23 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  69.23 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  72.38 
 
 		 111 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  64.41 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  60.98 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  67.62 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  58.88 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  73.87 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  50.46 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  65.25 
 
 		 153 aa  94.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  47.66 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  48.11 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  45.53 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  43.14 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  47.83 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  46.15 
 
 		 178 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  46.81 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  46.81 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  46.81 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  46.74 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  41.58 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  44 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  48.98 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  45.98 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  45.98 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  45.98 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  45.98 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  45.98 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  46.43 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  48.94 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  44.83 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  45.61 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  45.37 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  47.83 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  37.17 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  34.51 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  31.43 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  37.72 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  36.04 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  37.23 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  36.04 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1245  hypothetical protein  34.23 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000160953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  36.67 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  27.19 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  28.3 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  28.32 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  31.18 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>