More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0706 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  100 
 
 
344 aa  717    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  56.08 
 
 
348 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  53.15 
 
 
345 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  51.52 
 
 
311 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  51.78 
 
 
336 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  48.84 
 
 
336 aa  309  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  48.36 
 
 
325 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  47.45 
 
 
325 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  47.45 
 
 
325 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  47.38 
 
 
311 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  47.38 
 
 
311 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  44.48 
 
 
329 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  43.45 
 
 
322 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  43.5 
 
 
316 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  42.09 
 
 
315 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  41.49 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  42.51 
 
 
326 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  41.74 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  40.73 
 
 
363 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  41.61 
 
 
320 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  38.15 
 
 
358 aa  229  6e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  41.99 
 
 
312 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  38.24 
 
 
319 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  38.48 
 
 
348 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  41.14 
 
 
313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  41.14 
 
 
313 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  41.14 
 
 
313 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  37.94 
 
 
319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  40.84 
 
 
313 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  40.54 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  38.89 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  38.22 
 
 
333 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  39.24 
 
 
323 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  37.58 
 
 
325 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  38.81 
 
 
329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  38.62 
 
 
317 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  39.09 
 
 
322 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  34.44 
 
 
311 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  34.53 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  34.53 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.45 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.66 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.73 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1823  putative agmatinase  27.78 
 
 
268 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.397511  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  24.83 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  23.73 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  23.65 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  23.65 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  24.17 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  23.65 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  23.65 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  23.65 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  24.5 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  24.07 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.81 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.02 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  23.59 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  24.51 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  24.51 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  24.67 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  25.88 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  24.51 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  25.16 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.48 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  23.83 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  26.12 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.61 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  25.73 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  25.73 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  25.73 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  24.53 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  25.73 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  25.73 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  23.49 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  22.34 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  24.61 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  25.73 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  25.73 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  25.73 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  25.73 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  26.69 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  26.47 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  24.17 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  24.41 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  23.92 
 
 
416 aa  65.9  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  25.55 
 
 
297 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  25.63 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  24.43 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  25.16 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  25.08 
 
 
285 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.61 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  23.38 
 
 
340 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0897  putative agmatinase  24.51 
 
 
268 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.322484  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  24.92 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  26.95 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  23.75 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.19 
 
 
328 aa  63.2  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  25.35 
 
 
309 aa  63.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  26.05 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  25.99 
 
 
321 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>