53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1975 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  100 
 
 		 220 aa  465  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  36.02 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  36.71 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  36.08 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  36.02 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  34.2 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  33 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  33 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  33 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  32.24 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  32.38 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  32.38 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  32.38 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  32.38 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  34.2 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  27.91 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  31.44 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  26.26 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  25.13 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  28.34 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  27.84 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  26.94 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  29.74 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  25.13 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  28.16 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  26.56 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  24.12 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  23.35 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  29.02 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  24.87 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  24.62 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  22.05 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  22.61 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  25.13 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  29.77 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  25.66 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  25.62 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.6 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  25.45 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  20.55 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.62 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  29.45 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  21.54 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  17.92 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0096  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  21.97 
 
 		 505 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00355357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  19.88 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  22.49 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  27.97 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  21.23 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  21.23 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  19.44 
 
 		 212 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>