266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1511 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1511  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  288  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.401586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0707  hypothetical protein  57.35 
 
 
139 aa  176  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2827  putative lipoprotein  55.15 
 
 
139 aa  173  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0331828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  53.68 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.11 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4979  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.58 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  31.54 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2092  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.41 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0175411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2179  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.6 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.78 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3057  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.82 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0150  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.57 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4408  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.01 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1286  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.82 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.792681  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1573  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.03 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.112624  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0878  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.51 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6234  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.59 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.655235  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3558  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.97 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4618  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.82 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3468  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.37 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.4 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3511  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.58 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06309  hypothetical protein  31.5 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0334  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.23 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.35 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0763  hypothetical protein  29.84 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0409  hypothetical protein  32.23 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834181  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4350  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.32 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.300431 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1659  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.64 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3537  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.65 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0575  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.27 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0962204  hitchhiker  0.00000348554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  30.95 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4168  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.79 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.54 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1928  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.45 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0516617  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0497  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.32 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.15 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1655  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.5 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290612  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2171  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.5 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  31.67 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4517  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.6 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463989  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1980  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.41 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3405  hypothetical protein  30.36 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001426  hypothetical protein  30.25 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00259614  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3089  hypothetical protein  27.5 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2041  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.35 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000392642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0854  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.51 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.38 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07594  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15290)  27.64 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.47 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3816  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.67 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496132  normal  0.533485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0500  hypothetical protein  26.02 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.85 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0661  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.02 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.64 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.371874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1327  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.82 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28950  hypothetical protein  28.33 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.906248  hitchhiker  0.0000303722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.48 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.48 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0451  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.21 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4252  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.46 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1801  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.46 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  hitchhiker  0.00074845 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.46 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5167  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.51 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.578961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.48 
 
 
213 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0691  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.87 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.979336  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.64 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3212  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.81 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0424  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.47 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155822  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1514  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.06 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0403  hypothetical protein  26.45 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3022  hypothetical protein  32.26 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7106  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.61 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4001  hypothetical protein  27.73 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.51 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1277  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.57 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4010  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.33 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.48 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1578  hypothetical protein  26.02 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3911  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.67 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1891  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.78 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0984276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3257  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.62 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05940  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03180)  25.81 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.2 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0373  hypothetical protein  27.87 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.69 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1412  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.95 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233929  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.19 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  28.24 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1446  hypothetical protein  26.02 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3234  hypothetical protein  24.03 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0438  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.24 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.35 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3220  hypothetical protein  24.03 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3181  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.03 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2062  hypothetical protein  24.03 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2681  hypothetical protein  24.03 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0067  hypothetical protein  26.15 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610268  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1928  hypothetical protein  24.03 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>