19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0417 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0417  membrane protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0595  hypothetical protein  49.47 
 
 		 193 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000906711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1498  hypothetical protein  48.95 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000581479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3080  hypothetical protein  32.18 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000092136  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0023  hypothetical protein  30.27 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.0202898 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03240  uncharacterized membrane-associated protein  28.57 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.479554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.28 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  22.91 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.04 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  33.63 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  27.16 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.37 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  29.17 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  33.68 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  35.14 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  35.14 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  28.82 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  23.78 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  27.74 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>