23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06070 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06070  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2504  hypothetical protein  32.56 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0380502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0601  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.7 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  30.9 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  21.6 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 287 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  24.22 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  26.09 
 
 		 348 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.56 
 
 		 541 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  28.93 
 
 		 541 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  19.13 
 
 		 271 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  26.09 
 
 		 348 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  26.32 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  26.32 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  30.3 
 
 		 541 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  28.93 
 
 		 541 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  30.3 
 
 		 541 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  23.96 
 
 		 271 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  23.02 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>