34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06048 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  231  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001367  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  73.04 
 
 
116 aa  180  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  61.21 
 
 
116 aa  157  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4389  hypothetical protein  61.21 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  58.62 
 
 
146 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  58.62 
 
 
116 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  58.62 
 
 
116 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  58.62 
 
 
116 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0643  hypothetical protein  54.31 
 
 
116 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1833  hypothetical protein  62.93 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2024  hypothetical protein  62.07 
 
 
117 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275367  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  43.97 
 
 
116 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  38.79 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  37.07 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  37.07 
 
 
116 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  36.28 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  34.91 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1346  hypothetical protein  67.74 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1748  hypothetical protein  32.69 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1622  hypothetical protein  31.48 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1798  hypothetical protein  32.67 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1825  hypothetical protein  32.67 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1764  hypothetical protein  31.68 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3578  hypothetical protein  31.68 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1574  hypothetical protein  32.67 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1622  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1879  hypothetical protein  31.37 
 
 
109 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1583  hypothetical protein  31.68 
 
 
109 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  31.25 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1404  hypothetical protein  32.63 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2175  hypothetical protein  34.48 
 
 
116 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  26.76 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0892  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>