10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05619 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05619  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10058  ea59  45.02 
 
 
312 aa  207  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00755  hypothetical protein  44.4 
 
 
290 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  43.66 
 
 
516 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  34.58 
 
 
513 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  35.03 
 
 
540 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  31.02 
 
 
484 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  26.19 
 
 
556 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  22.56 
 
 
567 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  55.88 
 
 
265 aa  42  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>