27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05132 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001258  hypothetical protein  94.75 
 
 		 749 aa  757    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05132  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0073  hypothetical protein  35.08 
 
 		 768 aa  250  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.564783  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  30.77 
 
 		 659 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.89 
 
 		 835 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.89 
 
 		 835 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0343  proprotein convertase P  32.35 
 
 		 730 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000557566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  23.87 
 
 		 818 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.47 
 
 		 803 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 		 1158 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  26.89 
 
 		 840 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.23 
 
 		 823 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  33.71 
 
 		 794 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.1 
 
 		 819 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.1 
 
 		 819 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.1 
 
 		 819 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.1 
 
 		 819 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  28.57 
 
 		 803 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  30.12 
 
 		 677 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.82 
 
 		 836 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.07 
 
 		 818 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.17 
 
 		 775 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.25 
 
 		 835 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1093 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.08 
 
 		 1147 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.69 
 
 		 807 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  27.36 
 
 		 886 aa  42.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>