More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02109 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02109  hypothetical protein  100 
 
 
711 aa  1467    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1638  condensation domain-containing protein  44.18 
 
 
718 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3015  amino acid adenylation domain-containing protein  41.62 
 
 
1903 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0978  condensation domain-containing protein  42.09 
 
 
986 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.460756  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1801  nonribosomal peptide synthetase VibF  39.66 
 
 
2417 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  28.89 
 
 
2365 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  30.05 
 
 
7785 aa  198  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  29.09 
 
 
7310 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  28.47 
 
 
2386 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  32.08 
 
 
5620 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  30.79 
 
 
8211 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  29.77 
 
 
2605 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  27.12 
 
 
4090 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  28.02 
 
 
4290 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12405  peptide synthetase mbtE  28.17 
 
 
1731 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.517103  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.2 
 
 
2385 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  27.74 
 
 
2386 aa  171  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  27.07 
 
 
2385 aa  171  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.97 
 
 
2385 aa  170  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  27.45 
 
 
1745 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  27.45 
 
 
1745 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  27.78 
 
 
4520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  28.81 
 
 
4489 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  30.13 
 
 
2614 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 
4449 aa  168  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.85 
 
 
2385 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  27.25 
 
 
1745 aa  167  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  28.05 
 
 
2561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.74 
 
 
2385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  28.05 
 
 
3761 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  28.71 
 
 
6999 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  28.08 
 
 
1654 aa  163  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  28.3 
 
 
2403 aa  163  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.75 
 
 
7541 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19190  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  29.91 
 
 
3648 aa  161  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.349458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2696  amino acid adenylation domain-containing protein  27.31 
 
 
1762 aa  162  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502345  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  26.17 
 
 
2385 aa  161  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  26.76 
 
 
5738 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.95 
 
 
2385 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  29.21 
 
 
4317 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.95 
 
 
2385 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.4 
 
 
2385 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1746  amino acid adenylation domain protein  29.56 
 
 
3532 aa  158  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000653127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.54 
 
 
3639 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  29.5 
 
 
5750 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  30.18 
 
 
3786 aa  155  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  28.38 
 
 
11233 aa  154  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  27.08 
 
 
3223 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  28.54 
 
 
3629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  28.83 
 
 
3524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  27.21 
 
 
1721 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  27.49 
 
 
4317 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  27.97 
 
 
3710 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  29.56 
 
 
2250 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  26.64 
 
 
4317 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  26.44 
 
 
5213 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  27.72 
 
 
2691 aa  148  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  27.55 
 
 
4747 aa  148  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  25.4 
 
 
3086 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  26.34 
 
 
4317 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  25.27 
 
 
3086 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.33 
 
 
5328 aa  145  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  29.76 
 
 
7168 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  25.43 
 
 
1569 aa  144  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  25.41 
 
 
2395 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  25.41 
 
 
2664 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  25.41 
 
 
3824 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  26.37 
 
 
2201 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  25.41 
 
 
2395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  27.89 
 
 
5926 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  29.61 
 
 
4106 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  26.76 
 
 
2189 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  28.66 
 
 
6006 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  28.45 
 
 
3328 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  26.19 
 
 
6113 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  25.24 
 
 
2138 aa  141  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  28.45 
 
 
3352 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  28.66 
 
 
6081 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  22.28 
 
 
3453 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  25.42 
 
 
3291 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  26.48 
 
 
4336 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  24.21 
 
 
1550 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  25.48 
 
 
4502 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  26.82 
 
 
7122 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  28.45 
 
 
6072 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  27.45 
 
 
4572 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  26.06 
 
 
2054 aa  138  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  26.54 
 
 
2193 aa  138  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  25.61 
 
 
2581 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  29.41 
 
 
5953 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  25.85 
 
 
4318 aa  137  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.66 
 
 
2720 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  27.87 
 
 
3018 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  25.73 
 
 
3018 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  27.63 
 
 
4468 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  26.26 
 
 
4336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  26.38 
 
 
2333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  26.49 
 
 
2155 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  27.31 
 
 
6403 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  28.07 
 
 
3176 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>