13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004284 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004284  type 4 fimbrial biogenesis protein PilV  100 
 
 		 137 aa  282  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  72.22 
 
 		 125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01140  Tfp pilus assembly protein PilV  57.66 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0667  hypothetical protein  46.38 
 
 		 135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0216  hypothetical protein  26.32 
 
 		 551 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.590946  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  39.29 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  41.51 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  33.93 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  38.78 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  55.17 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  28.24 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2933  hypothetical protein  28.32 
 
 		 393 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2944  fimbrial biogenesis protein  26.62 
 
 		 362 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104726  normal  0.987031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>