23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001840 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001840  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  239  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  35.65 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  29.2 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1699  hypothetical protein  36.25 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1526  hypothetical protein  36.25 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2367  hypothetical protein  32.53 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406853  normal  0.0535079 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1519  hypothetical protein  36 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000380714  normal  0.0491707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1586  hypothetical protein  36 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.196957  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1755  hypothetical protein  35.14 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.196459  normal  0.218269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  28.95 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.530554  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2749  hypothetical protein  30.77 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188485  normal  0.0271892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1714  hypothetical protein  30.77 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0456721  hitchhiker  0.000000514861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2832  hypothetical protein  32.43 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2635  hypothetical protein  30.77 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.895876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2854  hypothetical protein  30.67 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  34.88 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  33.72 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  35.44 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  33.71 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  33.71 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  31.82 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>