22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1998 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1998  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1070    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2277  hypothetical protein  33.56 
 
 
536 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4665  hypothetical protein  28.87 
 
 
506 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2946  hypothetical protein  25.56 
 
 
570 aa  87  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0433  hypothetical protein  32.74 
 
 
569 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0833  hypothetical protein  22.2 
 
 
545 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.488386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3164  hypothetical protein  25.47 
 
 
534 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62222  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4748  hypothetical protein  28.18 
 
 
506 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2142  hypothetical protein  27.1 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.222842  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2739  hypothetical protein  22.26 
 
 
543 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.731986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1335  hypothetical protein  24.89 
 
 
455 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0403  hypothetical protein  37.86 
 
 
222 aa  57  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5390  hypothetical protein  21.54 
 
 
557 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.585501  normal  0.23439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4089  hypothetical protein  22.27 
 
 
468 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2666  hypothetical protein  22.65 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1804  hypothetical protein  24.12 
 
 
467 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611793  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0974  hypothetical protein  31.69 
 
 
660 aa  47  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.518342  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0134  hypothetical protein  22.11 
 
 
622 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0479641  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3064  hypothetical protein  22 
 
 
493 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0402  hypothetical protein  32.46 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0889  hypothetical protein  22.15 
 
 
591 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3225  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 
566 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.700942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>