12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0833 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1145    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.488386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2739  hypothetical protein  34.09 
 
 		 543 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.731986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2142  hypothetical protein  27.09 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1998  hypothetical protein  22.2 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4665  hypothetical protein  25 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2277  hypothetical protein  23.59 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4748  hypothetical protein  24.45 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3164  hypothetical protein  24.63 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2946  hypothetical protein  23.5 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0433  hypothetical protein  21.65 
 
 		 569 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0134  hypothetical protein  23.32 
 
 		 622 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0479641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0889  hypothetical protein  25.2 
 
 		 591 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>