14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3164 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3164  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1113    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2142  hypothetical protein  55.33 
 
 
528 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.222842  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2277  hypothetical protein  45.21 
 
 
536 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4665  hypothetical protein  41.59 
 
 
506 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708164 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4748  hypothetical protein  40.64 
 
 
506 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0433  hypothetical protein  40.23 
 
 
569 aa  353  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0403  hypothetical protein  46.15 
 
 
222 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2946  hypothetical protein  28.39 
 
 
570 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2739  hypothetical protein  23.5 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.731986  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1998  hypothetical protein  25.47 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0833  hypothetical protein  24.63 
 
 
545 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.488386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0974  hypothetical protein  23.95 
 
 
660 aa  70.5  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.518342  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0134  hypothetical protein  33.55 
 
 
622 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0479641  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0889  hypothetical protein  22.87 
 
 
591 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>