20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1335 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6336  hypothetical protein  70.07 
 
 
462 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.515423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1335  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  947    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3064  hypothetical protein  47.96 
 
 
493 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098434 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2666  hypothetical protein  47.93 
 
 
441 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0402  hypothetical protein  44.37 
 
 
442 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1804  hypothetical protein  46.65 
 
 
447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2186  hypothetical protein  45.93 
 
 
444 aa  354  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.0421946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2135  hypothetical protein  38.43 
 
 
503 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1804  hypothetical protein  38.36 
 
 
467 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611793  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2786  hypothetical protein  38.02 
 
 
473 aa  282  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4089  hypothetical protein  33.68 
 
 
468 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0206  hypothetical protein  33.26 
 
 
483 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744086  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3386  hypothetical protein  31.25 
 
 
440 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1057  hypothetical protein  26.54 
 
 
414 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0341619  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01791  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.927526  normal  0.421741 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0434  hypothetical protein  27.89 
 
 
444 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1907  hypothetical protein  25.45 
 
 
420 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5108  hypothetical protein  20.77 
 
 
436 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.15198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1688  hypothetical protein  24.27 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.643287  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1998  hypothetical protein  25.66 
 
 
528 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>