19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0434 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0434  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  895    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3386  hypothetical protein  59.08 
 
 
440 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1057  hypothetical protein  43.2 
 
 
414 aa  312  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0341619  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6336  hypothetical protein  26.56 
 
 
462 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.515423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1335  hypothetical protein  27.02 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1804  hypothetical protein  24.62 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611793  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0206  hypothetical protein  28.18 
 
 
483 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744086  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4089  hypothetical protein  24.05 
 
 
468 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5108  hypothetical protein  22.72 
 
 
436 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.15198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2135  hypothetical protein  24.14 
 
 
503 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0402  hypothetical protein  27.03 
 
 
442 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1804  hypothetical protein  26.07 
 
 
447 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2786  hypothetical protein  22.65 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3064  hypothetical protein  27.15 
 
 
493 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2186  hypothetical protein  26.48 
 
 
444 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.0421946 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2666  hypothetical protein  23.78 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1907  hypothetical protein  24.72 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1688  hypothetical protein  21.49 
 
 
407 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.643287  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01791  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.927526  normal  0.421741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>