20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6336 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6336  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  964    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.515423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1335  hypothetical protein  70.07 
 
 
455 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3064  hypothetical protein  47.11 
 
 
493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098434 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2666  hypothetical protein  48.16 
 
 
441 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0402  hypothetical protein  43.43 
 
 
442 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1804  hypothetical protein  44.42 
 
 
447 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2186  hypothetical protein  44.64 
 
 
444 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.0421946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2135  hypothetical protein  37.57 
 
 
503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1804  hypothetical protein  37.95 
 
 
467 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611793  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2786  hypothetical protein  38.24 
 
 
473 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4089  hypothetical protein  34.85 
 
 
468 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0206  hypothetical protein  37.67 
 
 
483 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744086  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1057  hypothetical protein  28.47 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0341619  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3386  hypothetical protein  28.24 
 
 
440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01791  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 
403 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.927526  normal  0.421741 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0434  hypothetical protein  26.91 
 
 
444 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1907  hypothetical protein  25.23 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5108  hypothetical protein  22.05 
 
 
436 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.15198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1688  hypothetical protein  21.72 
 
 
407 aa  57  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.643287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0134  hypothetical protein  22 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0479641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>