19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1804 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0402  hypothetical protein  65.84 
 
 
442 aa  635    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2186  hypothetical protein  81.04 
 
 
444 aa  759    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.0421946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1804  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  920    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2666  hypothetical protein  48.97 
 
 
441 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3064  hypothetical protein  47.36 
 
 
493 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6336  hypothetical protein  44.42 
 
 
462 aa  348  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.515423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1335  hypothetical protein  46.65 
 
 
455 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1804  hypothetical protein  37.79 
 
 
467 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611793  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2135  hypothetical protein  36.68 
 
 
503 aa  272  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2786  hypothetical protein  36.75 
 
 
473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0206  hypothetical protein  35.95 
 
 
483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744086  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4089  hypothetical protein  31.61 
 
 
468 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1057  hypothetical protein  27.59 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0341619  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1907  hypothetical protein  27.46 
 
 
420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01791  conserved hypothetical protein  27.13 
 
 
403 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.927526  normal  0.421741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5108  hypothetical protein  23.88 
 
 
436 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.15198 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3386  hypothetical protein  26.28 
 
 
440 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0434  hypothetical protein  26.07 
 
 
444 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1688  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.643287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>