13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5390 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5390  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1172    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.585501  normal  0.23439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0138  hypothetical protein  28.98 
 
 		 749 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0889  hypothetical protein  30.17 
 
 		 591 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0089  hypothetical protein  26.59 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3225  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.700942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1998  hypothetical protein  21.54 
 
 		 528 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.82 
 
 		 406 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  22.8 
 
 		 381 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.307067 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.11 
 
 		 394 aa  47  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  21.43 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  22.62 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  23.37 
 
 		 381 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  19.63 
 
 		 1050 aa  43.5  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>