42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1650 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  43.16 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  43.16 
 
 
299 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  43.01 
 
 
297 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  41.96 
 
 
297 aa  202  8e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.01 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.88 
 
 
285 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  34.75 
 
 
287 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.83 
 
 
291 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  30.71 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  31.69 
 
 
291 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  30.42 
 
 
284 aa  136  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  30.42 
 
 
284 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  30.71 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.74 
 
 
300 aa  135  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  30.47 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.41 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  31.79 
 
 
288 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.14 
 
 
289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.82 
 
 
292 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  31.05 
 
 
291 aa  125  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.96 
 
 
293 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  32.62 
 
 
293 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.23 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  31.07 
 
 
292 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  32.75 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  32.81 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.53 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  35.42 
 
 
319 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.59 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  28.3 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  27 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.88 
 
 
360 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  25.98 
 
 
368 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  27.27 
 
 
383 aa  49.3  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  26.57 
 
 
374 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  25.59 
 
 
371 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  24.12 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.87 
 
 
396 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  25 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  24.64 
 
 
376 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.7 
 
 
376 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>