21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0931 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0931  aminopeptidase  100 
 
 
539 aa  1066    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0562565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0072  hypothetical protein  33.51 
 
 
438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0107  hypothetical protein  31.38 
 
 
436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1146  hypothetical protein  30.87 
 
 
436 aa  110  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000092529 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0099  hypothetical protein  33.25 
 
 
435 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.428389  decreased coverage  0.00133655 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1783  conserved hypothetical protein  22.16 
 
 
488 aa  76.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.96 
 
 
456 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  30.71 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  26.35 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  28.62 
 
 
454 aa  61.6  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.18 
 
 
497 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  28.06 
 
 
440 aa  57  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  28.62 
 
 
454 aa  53.9  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.92 
 
 
447 aa  53.9  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  29.24 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  22.61 
 
 
487 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  32.27 
 
 
438 aa  50.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  24.43 
 
 
462 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  23.65 
 
 
698 aa  47.4  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  32.67 
 
 
463 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1393  peptidase M28  27.85 
 
 
361 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0177008  unclonable  0.000000310034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>