14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1393 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1393  peptidase M28  100 
 
 		 361 aa  740    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0177008  unclonable  0.000000310034 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1783  conserved hypothetical protein  24.06 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  27.23 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.35 
 
 		 456 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0072  hypothetical protein  24.12 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  27.44 
 
 		 440 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  27.8 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  25.74 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0107  hypothetical protein  23.48 
 
 		 436 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  23.28 
 
 		 491 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0931  aminopeptidase  27.85 
 
 		 539 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0562565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  28.84 
 
 		 438 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  25.33 
 
 		 454 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  26.04 
 
 		 436 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>