44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0858 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  332  1e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  40.58 
 
 
168 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  43.08 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  41.73 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  40.32 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  41.03 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.89 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  35.48 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0414  protein of unknown function DUF123  45.16 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.5 
 
 
356 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  29.84 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  30.88 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  37.39 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  38.21 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  33.75 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  36.81 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  40.94 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  37.41 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  41.67 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  32.47 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  37.4 
 
 
141 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  35.96 
 
 
133 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  36.97 
 
 
356 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.29 
 
 
356 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.13 
 
 
356 aa  62  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  35.46 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  37.82 
 
 
137 aa  61.6  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  39.5 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  32.41 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  37.89 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  30.16 
 
 
138 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  30.34 
 
 
197 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  34.71 
 
 
139 aa  54.7  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  37.61 
 
 
128 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  28.74 
 
 
189 aa  48.5  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  40.82 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0051  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  27.12 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  30.41 
 
 
197 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  43.94 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>