55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4085 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 319 aa  651    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  43.98 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  43.22 
 
 		 271 aa  208  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  39.42 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  38.85 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  36.68 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  39.43 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  40.49 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  39.1 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  38.58 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  36.94 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  37.64 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  37.64 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  37.64 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  39.69 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  39.04 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  38.89 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  38.89 
 
 		 343 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  38.89 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  28.99 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  30.97 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  31.62 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  27.71 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  25.86 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  26.58 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  26.58 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  24.14 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  24.14 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  24.14 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  22.81 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  22.94 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  34.04 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  23.38 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  24.29 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1496  Protein of unknown function DUF2236  21.89 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  32.98 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  32.98 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  25.24 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  25.45 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  25.77 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  24.4 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  29.01 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  24.02 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  26.42 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  25.84 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5273  hypothetical protein  25.37 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  25.28 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  25.28 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  27.22 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  34.04 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  34.04 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  34.04 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>