83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2478 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
379 aa  751    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2934  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 
368 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3360  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
171 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  27.64 
 
 
444 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4054  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
171 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.236772  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2084  N-acetylglutamate synthase  27.68 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
149 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
149 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  26.84 
 
 
465 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  25.91 
 
 
440 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1078  N-acetylglutamate synthase  26.84 
 
 
465 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0664  N-acetylglutamate synthase  27.04 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0813  N-acetylglutamate synthase  27.04 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  26.07 
 
 
448 aa  52.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  26.07 
 
 
448 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  31.18 
 
 
459 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  31.18 
 
 
459 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  31.18 
 
 
459 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  31.18 
 
 
459 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  31.18 
 
 
459 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  31.18 
 
 
459 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  28.35 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  29.8 
 
 
462 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  29.8 
 
 
462 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  29.19 
 
 
477 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1250  N-acetylglutamate synthase  25.79 
 
 
451 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676607  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  26.83 
 
 
448 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  29.8 
 
 
459 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0380  N-acetylglutamate synthase  28.27 
 
 
442 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  28.22 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  27.69 
 
 
442 aa  50.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  27.09 
 
 
439 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  27.46 
 
 
438 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
459 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1184  acetyltransferase  26.52 
 
 
152 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  30.59 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  27.43 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  27.23 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2295  amino-acid N-acetyltransferase  23.33 
 
 
456 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0223326 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0474  acetyltransferase  27.94 
 
 
155 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0416407 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0307  acetyltransferase  28.03 
 
 
152 aa  47.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
458 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  26.32 
 
 
440 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
458 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
458 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
458 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
458 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
458 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
458 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  28.5 
 
 
432 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  28.5 
 
 
432 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0598  N-acetylglutamate synthase  19.59 
 
 
453 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00244264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  25.61 
 
 
448 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0871  N-acetylglutamate synthase  26.22 
 
 
448 aa  46.6  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0354  N-acetylglutamate synthase  27.54 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  26.32 
 
 
624 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2228  N-acetylglutamate synthase  25.61 
 
 
446 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1373  N-acetylglutamate synthase  26.22 
 
 
446 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  28.5 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0452  acetyltransferase  25.78 
 
 
152 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  25 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  28.91 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  25.58 
 
 
157 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1344  amino-acid N-acetyltransferase  26.41 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0977  N-acetylglutamate synthase  24.22 
 
 
436 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
147 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10902  predicted protein  26.09 
 
 
473 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
182 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2397  N-acetylglutamate synthase  25.61 
 
 
449 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.989062  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  28.5 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  29.05 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  24.06 
 
 
624 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2308  acetyltransferase  31.88 
 
 
165 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  25.61 
 
 
450 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4141  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
167 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  24.43 
 
 
624 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5949  N-acetylglutamate synthase  27.75 
 
 
432 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
164 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2105  N-acetylglutamate synthase  25.93 
 
 
451 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2113  acetyltransferase  25.74 
 
 
153 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68740  N-acetylglutamate synthase  27.75 
 
 
432 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
187 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0713  N-acetylglutamate synthase  25.91 
 
 
437 aa  43.1  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>