12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2978 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2978  peptidase domain protein  100 
 
 
344 aa  716    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4313  peptidase domain-containing protein  65.28 
 
 
340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  40.89 
 
 
394 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0821  peptidase, metallopeptidase  35.29 
 
 
277 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.569838  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0499  peptidase M12A, astacin  32.01 
 
 
353 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1096  hypothetical protein  34.25 
 
 
223 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  50.55 
 
 
495 aa  97.4  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1097  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4249  peptidase M12A, astacin  28.36 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1339  hypothetical protein  34.22 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1530  hypothetical protein  34.03 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0114  hypothetical protein  29.23 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>