56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2975 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  40.38 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  42.78 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  40.72 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  36.97 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  32.88 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  32.88 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  32.88 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  32.88 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  27.57 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  32.7 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  31.28 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  31.32 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  31.75 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  37.21 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  31.44 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  28.11 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  28.44 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  27.62 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  27.94 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  30.59 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  26.64 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  30.7 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  26.39 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  32.7 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  25.58 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  25.58 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  25.58 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  27.85 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  28.43 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  28.7 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  30.65 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  25.51 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  27.23 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  29.3 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  25.62 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  25.93 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  28.44 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  27.49 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  29.3 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  31.4 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  26.09 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  27.08 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  22.73 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  28.57 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.36 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.09 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  28.85 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  28.74 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  33.08 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  25.32 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  30.86 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  24.88 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  25.24 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>