13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2080 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2080  O-antigen polymerase  100 
 
 		 411 aa  821    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.473077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2125  O-antigen polymerase  37.68 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1303  hypothetical protein  28.57 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.424505  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  32.94 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 773 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  24.66 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  27.16 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  22.87 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  21.99 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  32.43 
 
 		 503 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  23.74 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>