118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1613 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1613  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  65.33 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1287  serine/threonine protein kinase  63.55 
 
 
330 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000310497  hitchhiker  0.00149361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  62.58 
 
 
359 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  63.79 
 
 
346 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0540  serine/threonine protein kinase  61.74 
 
 
347 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205234  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  63.79 
 
 
343 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  62.38 
 
 
327 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  63.79 
 
 
346 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  63.79 
 
 
343 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  63.79 
 
 
343 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  63.79 
 
 
343 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  63.79 
 
 
343 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0518  serine/threonine protein kinase  61.66 
 
 
346 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  60.47 
 
 
332 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  60.93 
 
 
342 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6422  serine/threonine protein kinase  61.92 
 
 
343 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  62.46 
 
 
346 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2459  serine/threonine protein kinase  61.59 
 
 
343 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3073  serine/threonine protein kinase  61.59 
 
 
343 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3069  serine/threonine protein kinase  61.59 
 
 
343 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  61.92 
 
 
340 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3119  serine/threonine protein kinase  60.93 
 
 
343 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3091  serine/threonine protein kinase  61.26 
 
 
343 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2984  serine/threonine protein kinase  60.93 
 
 
343 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0421  serine/threonine protein kinase  59.81 
 
 
344 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.083044  hitchhiker  0.000109607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0435  serine/threonine protein kinase  58.68 
 
 
350 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  60.9 
 
 
348 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  57 
 
 
327 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  54.64 
 
 
328 aa  349  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000117305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  56.33 
 
 
328 aa  347  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2918  serine/threonine protein kinase  54.97 
 
 
328 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  54.3 
 
 
328 aa  347  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  54.97 
 
 
328 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3019  serine/threonine protein kinase  53.97 
 
 
328 aa  342  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  55.67 
 
 
324 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0936  serine/threonine protein kinase  56.15 
 
 
329 aa  325  5e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0552  serine/threonine protein kinase  54.11 
 
 
360 aa  325  7e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  55 
 
 
335 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  54.67 
 
 
324 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  54.64 
 
 
341 aa  321  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  53 
 
 
355 aa  318  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  54.33 
 
 
324 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  53.5 
 
 
354 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  54.52 
 
 
342 aa  315  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  53.67 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  54.64 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05960  serine/threonine protein kinase  54 
 
 
324 aa  311  9e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0484  hypothetical protein  52.33 
 
 
324 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  51.74 
 
 
351 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  53.67 
 
 
324 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  52.94 
 
 
338 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0621  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
357 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5180  serine/threonine protein kinase  51.67 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000688242  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3582  serine/threonine protein kinase  50.8 
 
 
349 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1193  serine/threonine protein kinase  54.63 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  53.82 
 
 
346 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  53.82 
 
 
346 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  52.67 
 
 
324 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2760  serine/threonine protein kinase  49.34 
 
 
339 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  52.36 
 
 
345 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4697  serine/threonine protein kinase  53.33 
 
 
324 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  51.69 
 
 
340 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  50.34 
 
 
345 aa  294  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  51.69 
 
 
340 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  51.69 
 
 
340 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2484  serine/threonine protein kinase  49.34 
 
 
340 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00403  serine/threonine protein kinase  48.68 
 
 
340 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  51.35 
 
 
340 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  48.34 
 
 
334 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  51.35 
 
 
330 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  51.01 
 
 
345 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  51.01 
 
 
351 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  48.65 
 
 
333 aa  288  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3574  serine/threonine protein kinase  47.67 
 
 
321 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4349  serine/threonine protein kinase  48 
 
 
328 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  47.3 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0045  serine/threonine protein kinase  48.01 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4969  serine/threonine protein kinase  51.12 
 
 
344 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  47.64 
 
 
334 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  47.3 
 
 
329 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  48.31 
 
 
342 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 
334 aa  268  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4156  serine/threonine protein kinase  46.36 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0206015  hitchhiker  0.0000791829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4240  serine/threonine protein kinase  46.36 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00616333  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5299  serine/threonine protein kinase  46.36 
 
 
328 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.281627  normal  0.624144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  46.03 
 
 
328 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4127  aminoglycoside phosphotransferase  46.03 
 
 
328 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  46.03 
 
 
328 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  46.03 
 
 
328 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000811117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4377  serine/threonine protein kinase  46.03 
 
 
328 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000124881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4331  serine/threonine protein kinase  46.36 
 
 
328 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0019  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 
328 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000857443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0021  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 
328 aa  261  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00225074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4197  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 
328 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  43.71 
 
 
328 aa  258  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4277  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 
328 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4206  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 
328 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0481233  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4227  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 
328 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000275192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4384  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 
328 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.713425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>