156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1400 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1400  protein of unknown function DUF255  100 
 
 
628 aa  1273    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0823  protein of unknown function DUF255  39.04 
 
 
635 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.0427489 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1975  hypothetical protein  35.68 
 
 
582 aa  350  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  37.85 
 
 
717 aa  302  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  35.01 
 
 
715 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  33.5 
 
 
707 aa  290  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  35.4 
 
 
686 aa  286  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  32.89 
 
 
705 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  35.37 
 
 
685 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  33.21 
 
 
686 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  36.58 
 
 
733 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  33.55 
 
 
684 aa  284  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  34.87 
 
 
669 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  33.7 
 
 
712 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  36.99 
 
 
665 aa  279  9e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  37.04 
 
 
662 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  39.08 
 
 
664 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  39.08 
 
 
664 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  34.05 
 
 
693 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  37.15 
 
 
696 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  33.01 
 
 
690 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  36.94 
 
 
700 aa  275  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  36.79 
 
 
666 aa  274  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  36.49 
 
 
722 aa  273  5.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  35.3 
 
 
656 aa  273  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  37.75 
 
 
664 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01057  DUF255 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12370)  29.85 
 
 
774 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0181431 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  35.87 
 
 
744 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  31.14 
 
 
680 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  34.97 
 
 
711 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  35.5 
 
 
672 aa  270  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  38.68 
 
 
667 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  33.91 
 
 
681 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  29.81 
 
 
675 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  35.36 
 
 
596 aa  266  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  33.71 
 
 
680 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  27.76 
 
 
703 aa  265  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  36.16 
 
 
677 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  36.62 
 
 
682 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  36.42 
 
 
665 aa  265  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  28.18 
 
 
681 aa  264  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  40.14 
 
 
679 aa  262  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  34.43 
 
 
697 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  32.32 
 
 
699 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  34.95 
 
 
673 aa  260  6e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  32.94 
 
 
673 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  29.08 
 
 
686 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  35.62 
 
 
696 aa  258  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  35 
 
 
725 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 
720 aa  257  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  34.44 
 
 
610 aa  256  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  36.27 
 
 
673 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  33.72 
 
 
718 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  34.85 
 
 
667 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  26.09 
 
 
687 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  33.03 
 
 
706 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  33.27 
 
 
737 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  36.15 
 
 
658 aa  254  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  34.35 
 
 
706 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  34.47 
 
 
665 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  32.51 
 
 
711 aa  253  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  31.87 
 
 
700 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  35.98 
 
 
839 aa  252  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  38.95 
 
 
699 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  31.87 
 
 
746 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  35.1 
 
 
660 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  36.99 
 
 
677 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  35.18 
 
 
678 aa  249  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  32.13 
 
 
750 aa  247  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  36.1 
 
 
657 aa  247  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  34.33 
 
 
718 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  33.01 
 
 
699 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  37.28 
 
 
682 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  35.4 
 
 
615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  31.52 
 
 
641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  34.13 
 
 
718 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  31.38 
 
 
671 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  36.65 
 
 
699 aa  243  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  33.09 
 
 
751 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  34.99 
 
 
681 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  31.7 
 
 
670 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  31.41 
 
 
720 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  33.14 
 
 
692 aa  241  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  33.87 
 
 
694 aa  240  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  35.79 
 
 
666 aa  240  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  35.79 
 
 
666 aa  240  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  35.06 
 
 
714 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  36.3 
 
 
676 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  32.67 
 
 
700 aa  239  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  35.74 
 
 
593 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  35.34 
 
 
715 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  36.85 
 
 
610 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  33.33 
 
 
700 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  36.07 
 
 
676 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  36.72 
 
 
673 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  36.41 
 
 
682 aa  236  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  32.1 
 
 
687 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  29.81 
 
 
681 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  37.64 
 
 
669 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  32.45 
 
 
756 aa  233  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>