15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1052 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1052  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  41.4 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1796  hypothetical protein  33.19 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.207584  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  34.07 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.76 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.22 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  37.25 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  36.08 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.64 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03069  putative secreted protein  36.23 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0673  hypothetical protein  27.1 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  32.35 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  35.42 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  32.04 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>