32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2521 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  540  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  61.06 
 
 
318 aa  271  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  44.93 
 
 
321 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  42.19 
 
 
308 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  44.15 
 
 
314 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  43.68 
 
 
327 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  47.92 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  48.39 
 
 
325 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  39.93 
 
 
360 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  42.86 
 
 
451 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  38.52 
 
 
340 aa  148  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  39.27 
 
 
327 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  44.12 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  41.04 
 
 
306 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  39.83 
 
 
316 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  39.17 
 
 
348 aa  89.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  34.08 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  28.33 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  22 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  28.11 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  24.83 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  24.19 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  21.3 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  24.28 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  23.64 
 
 
320 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3850  hypothetical protein  24.24 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  21.12 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  24.51 
 
 
294 aa  46.2  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5232  hypothetical protein  25.83 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1821  hypothetical protein  21.2 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0667  hypothetical protein  30.2 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  0.807997 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05521  hypothetical protein  19.47 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>