20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001054 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  25.88 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  27.75 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07041  hypothetical protein  25.57 
 
 
327 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  26.69 
 
 
321 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  22.26 
 
 
316 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0667  hypothetical protein  25.71 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  0.807997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1693  hypothetical protein  24.92 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  24.81 
 
 
327 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  26.09 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1821  hypothetical protein  37.31 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04891  hypothetical protein  22.92 
 
 
324 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.879079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  24.61 
 
 
318 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0022  hypothetical protein  33.82 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0129  hypothetical protein  23.01 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43686  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  24.08 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5232  hypothetical protein  26.05 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2414  hypothetical protein  33.9 
 
 
307 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3697  hypothetical protein  33.9 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  23.64 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>