32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2552 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  549  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  42.97 
 
 
327 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  43.22 
 
 
360 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  38.33 
 
 
308 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  43.31 
 
 
325 aa  169  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  39.93 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  46.62 
 
 
323 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  43.22 
 
 
451 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  42.86 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  38.14 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  42.55 
 
 
297 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  47.75 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  42.6 
 
 
327 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  32.03 
 
 
340 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  37.67 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  34.69 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  26.28 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  25.25 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  20.72 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3850  hypothetical protein  27.63 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  18.18 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  23.11 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  34.72 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07041  hypothetical protein  29.63 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  22.27 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1821  hypothetical protein  21.18 
 
 
321 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0204007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0906  inner membrane protein YbhN  35.65 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.409444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  35.65 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  35.65 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  35.65 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0874  inner membrane protein YbhN  35.65 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0140  hypothetical protein  26.38 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.89303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>