23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1370 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  610  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  60.85 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  46.4 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  44.87 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  41.48 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  40.63 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  46.34 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  39.78 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  42.68 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  37.54 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  34.3 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  40.96 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  41.41 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  37.08 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  34.39 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  26.03 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  24.52 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  22.9 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3850  hypothetical protein  24.72 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  25.28 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  30.4 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5232  hypothetical protein  25.17 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>